Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA4P48169 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms