Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV4P43268 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ETV4P43268 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV4P43268 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV4P43268 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms