Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDIT3P35638 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms