Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD13P35453 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms