Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRMP28827 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
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