Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IL3RAP26951 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms