Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRZ1P23471 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms