Protein–RNA interactions for Protein: P22680

CYP7A1, Cholesterol 7-alpha-monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP7A1P22680 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms