Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT1P21579 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT1P21579 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT1P21579 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT1P21579 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT1P21579 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms