Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA5P20719 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms