Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD33P20138 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD33P20138 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD33P20138 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms