Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL3P19876 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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