Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms