Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XBP1P17861 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XBP1P17861 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms