Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME1P15531 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME1P15531 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME1P15531 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME1P15531 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms