Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A1P13866 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A1P13866 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms