Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP1P11387 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP1P11387 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms