Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms