Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDHBP07195 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LDHBP07195 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHBP07195 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms