Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DOAP06340 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms