Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SERPIND1P05546 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms