Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGFRP00533 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGFRP00533 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EGFRP00533 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGFRP00533 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms