Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TOMM40O96008 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOMM40O96008 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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