Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX58O95786 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX58O95786 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX58O95786 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX58O95786 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX58O95786 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms