Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMTA2O94983 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMTA2O94983 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms