Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP19O94966 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP19O94966 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP19O94966 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP19O94966 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP19O94966 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP19O94966 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP19O94966 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms