Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG12O94817 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms