Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SURF6O75683 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF6O75683 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF6O75683 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SURF6O75683 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SURF6O75683 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF6O75683 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms