Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNSO60931 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNSO60931 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNSO60931 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNSO60931 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNSO60931 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNSO60931 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms