Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPLO60437 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPLO60437 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPLO60437 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPLO60437 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPLO60437 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPLO60437 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms