Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRICKLE3O43900 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms