Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC28A2O43868 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms