Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB2O43741 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms