Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms