Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms