Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTIFO43310 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTIFO43310 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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