Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VGFO15240 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VGFO15240 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VGFO15240 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VGFO15240 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VGFO15240 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VGFO15240 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VGFO15240 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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