Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms