Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3EO15041 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms