Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PHOX2AO14813 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms