Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLIM4O00461 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLIM4O00461 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms