Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DFFAO00273 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DFFAO00273 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DFFAO00273 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DFFAO00273 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms