Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP23O00161 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms