Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CCDC179H3BU77 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CCDC179H3BU77 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms