Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms