Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms