Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms