Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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