Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIPT2A6NK58 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms