Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms